10x Genomics 单细胞转录组测序

1. 基因定量质控 1.1 Cell Ranger质控 1.1.1 测序数据产出统计 1.1.2 测序碱基质量统计 1.1.3 测序饱和度统计 1.1.4 高质量细胞数统计 1.1.5 基因组比对率统计 1.2 定量后Seurat质控 1.2.1 基因表达数目统计和细胞过滤 1.2.2 UMI数目统计和细胞过滤 1.2.3线粒体基因比例统计和细胞过滤 1.2.4 logXGenesPerUMI统计和细胞过滤 1.2.5 红细胞比例统计和细胞过滤 2. 降维聚类X析 2.1 UMAP/tSNE 降维聚类 2.2 聚类结果X组展示（≥2个样本） 2.2.1聚类X面展示图 2.2.2 X组柱状统计图 3. 细胞群间相似性X析 4. Marker基因鉴定 4.1 特征基因鉴定 4.2 特征基因表达热图 4.3 特征基因表达小提琴图 4.4 特征基因FeaturePlot 5. 细胞类型注释（除特殊物种） 5.1 细胞类型参考结果图 5.2 细胞类型鉴定相关性热图 5.3 细胞类型注释统计表 6. 差异基因X析 6.1 差异表达基因筛选 6.2 上下调 TopX 差异基因热图 7. 差异基因功能X析 7.1 差异基因GO功能富集X析 7.1.1 GO富集条形图 7.1.2 差异基因和所有基因GO level2水平X布比较图 7.1.3 上下调基因GO Level2水平X布比较图 7.2 差异基因KEGG功能富集X析 7.2.1 KEGG富集气泡图 7.2.2 差异基因和所有基因在KEGG Level2水平X布比较图 7.2.3 上下调基因在KEGG Level2水平X布比较图 8X络互作X析（除特殊物种） 8.1X络图 8.2 上X络图

(1) 本项目服务期为一年。(2) 质量保证期为一年。